Chile ocupa el noveno lugar en la producción acuícola mundial, con 800 mil toneladas anuales y con retornos sobre los US$ 4 mil millones. Es el segundo productor mundial de salmones y mitílidos, generando un empleo directo e indirecto para aproximadamente 80 mil personas.
Por su parte, durante la última década se ha impulsado la diversificación de la acuicultura chilena con nuevas especies con alto potencial económico, como la seriola, corvina, congrios dorado y colorado, almejas, machas, repoblamiento de choritos y locos, y extracción y comercialización de algas.
El área de Acuicultura y Ecosistemas Marinos se enfoca en el desarrollo de productos y servicios en los ámbitos sanitarios, medioambientales y productivos, de interés para la industria, a través de proyectos de investigación biotecnológica aplicada.